Financé par l’ANR dans le cadre du programme « Investissements d’Avenir », ECOFECT est un Laboratoire d’Excellence sélectionné en 2011 et regroupe 195 personnes. Il vise à décrypter les maladies infectieuses et leur rôle dans l’évolution des organismes pour mieux les prévenir et les soigner; à comprendre comment les changements globaux transforment les maladies humaines et animales, et ambitionne de développer des diagnostics intégrés et des traitements plus justes.
ECOFECT construit une expertise nouvelle, en se fondant sur la complémentarité de différentes communautés d’excellence existant sur Lyon : d’une part virologues, bactériologistes, immunologistes et cliniciens, et d’autre part écologues et évolutionnistes. 
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